Свою трудовую деятельность в судебном системе Юрий Николаевич начал с 2002 года.
С 08 января 2002 года в соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 05.12.2001 №1406 Юрий Николаевич Колесников был назначен на должность судьи Чагодощенского районного суда на трехлетний срок полномочий. Указом Президента РФ от 05.04.2006 г. №319 Юрий Николаевич назначен судьей без ограничения срока полномочий.